Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1157066	1157196	131	19 [0]	[0] 74	tmk	thymidylate kinase

TCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATACC  >  W3110S.gb/1157197‑1157258 |                                                              tCTTTAATCGTACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1147554/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACATGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:16022/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAATAGCATTCATAcc  <  1:1459949/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:52877/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:67725/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:669000/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:624391/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:582132/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:545516/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:540277/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:531569/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:718608/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:511403/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:488708/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:478754/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:458925/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:448423/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:438603/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:429115/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:397787/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:838561/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:998194/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:995578/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:956023/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:927757/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:900065/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:892684/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:870415/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:869338/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:866073/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:679458/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:817181/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:806537/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:775703/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:754232/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:75175/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:723512/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:722276/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:35938/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1192123/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:142464/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1418495/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1350801/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:134376/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1277740/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1245792/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1214580/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1202749/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:142472/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1176557/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1173089/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1148322/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1124694/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1071372/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:105332/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1036474/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1031541/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:2368/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1011296/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:350909/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:344524/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:336275/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:319023/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:291477/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:264616/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:249910/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:381227/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:21719/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:20262/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:188465/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:181926/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:154994/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1440557/62‑1 (MQ=255) tCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATAcc  <  1:1435936/62‑1 (MQ=255) |                                                              TCTTTAATCGCACCCGCGCCCGCTATCTGGAACTGGCAGCACAAGATAAAAGCATTCATACC  >  W3110S.gb/1157197‑1157258

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑