Missing coverage evidence...
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GGGTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCG  >  W3110S.gb/1158488‑1158549 |                                                              gggTTATTTACATATGCGTGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:398552/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTTGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1181419/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:622952/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:386917/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:414092/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:428712/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:448791/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:480828/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:490494/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:526922/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:543292/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:556146/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:603002/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:264621/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:670291/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:704813/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:751597/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:780214/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:790653/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:798910/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:829332/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:903482/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:961685/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:13592/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:112108/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1142729/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1143045/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1144679/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1224202/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1242725/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:128986/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1309326/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1331614/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1357223/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:320784/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1394016/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1421502/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1438624/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:14594/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:167819/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:182472/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:222991/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:223109/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:263170/62‑1 (MQ=255) gggTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCg  <  1:1092816/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGGTTATTTACATATGCGGGATCTGGTAGGCGAACGTGACAACGTCGTATTTTCTTGTGGCG  >  W3110S.gb/1158488‑1158549

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑