Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1163898	1163900	3	4 [0]	[0] 40	ycfL	hypothetical protein

GGTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCA  >  W3110S.gb/1163901‑1163961 |                                                             ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGTAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:229965/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGcg  <  1:1267051/61‑2 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:694542/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:421250/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:464108/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:519234/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:526066/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:526582/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:532395/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:542071/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:567205/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:617310/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:392187/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:715885/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:721019/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:757789/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:810551/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:81211/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:873891/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:875525/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:922833/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:1345405/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:1113936/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:1126290/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:1141373/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:1143446/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:1201773/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:1247405/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:1259206/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:1284889/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:1324639/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:418939/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:135268/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:136666/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:1444531/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:160800/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:31321/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:316293/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:320001/61‑1 (MQ=255) ggTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCa  <  1:1042050/61‑1 (MQ=255) |                                                             GGTGAATGATGAGCAATCGCTGGTGATGGAGTCATCTTTATTGGCTGCGGGCATCAGTGCA  >  W3110S.gb/1163901‑1163961

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑