Missing coverage evidence...
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TTGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAG  >  W3110S.gb/1208575‑1208636 |                                                              ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGGGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:1018364/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGTGAg  >  1:1131441/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:717677/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:289919/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:311738/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:315336/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:315765/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:362612/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:390783/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:43807/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:496647/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:516036/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:614510/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:26728/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:848697/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:856407/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:857096/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:881939/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:905486/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:936698/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:952478/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:954913/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:977400/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:99172/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:1442419/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:102687/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:1057521/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:1165959/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:1242894/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:1260724/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:1264369/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:1297488/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:1323725/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:1350745/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:1430604/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:278042/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:1446572/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:156594/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:169037/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:219676/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:222088/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:226793/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:227887/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:233646/1‑62 (MQ=255) ttGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAg  >  1:264430/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTGCCGGTGCGGCACCGTCATTAACCCGTGTTCATCAGCGTGCGGATGCCCTGATGCGGGAG  >  W3110S.gb/1208575‑1208636

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑