Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1212782	1212928	147	33 [0]	[0] 9	mcrA/icdC	5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease B/ECK1146:JW5173:b4519; conserved hypothetical protein

ATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGA  >  W3110S.gb/1212929‑1212973 |                                             atatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGa  <  1:1071445/45‑1 (MQ=255) atatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGa  <  1:1296664/45‑1 (MQ=255) atatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGa  <  1:361963/45‑1 (MQ=255) atatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGa  <  1:392660/45‑1 (MQ=255) atatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGa  <  1:421079/45‑1 (MQ=255) atatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGa  <  1:498201/45‑1 (MQ=255) atatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGa  <  1:664780/45‑1 (MQ=255) atatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGa  <  1:734055/45‑1 (MQ=255) atatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGa  <  1:900703/45‑1 (MQ=255) |                                             ATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGA  >  W3110S.gb/1212929‑1212973

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑