Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1238348	1238496	149	35 [1]	[0] 28	ycgB	conserved hypothetical protein

TCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACC  >  W3110S.gb/1238497‑1238557 |                                                             tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTTATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:330511/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTTTTGAcc  <  1:681846/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:38951/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:891606/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:83773/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:803811/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:798748/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:755898/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:628074/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:599548/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:587348/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:573833/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:515483/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:408926/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:390563/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:1009221/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:313876/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:234444/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:208805/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:162006/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:1472540/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:1442416/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:1373541/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:1239823/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:1238090/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:1226093/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:1188448/61‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGAcc  <  1:1069110/61‑1 (MQ=255) |                                                             TCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACC  >  W3110S.gb/1238497‑1238557

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑