Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1269278	1269283	6	21 [0]	[0] 52	ychA	predicted transcriptional regulator

GAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTAA  >  W3110S.gb/1269284‑1269338 |                                                       gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTTATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:571177/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTTACGGTGAATCGTTaa  <  1:1052436/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:754093/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:532257/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:570893/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:581423/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:614903/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:623209/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:669247/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:670658/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:685679/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:718901/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:721796/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:753218/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:426880/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:768126/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:846767/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:849987/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:88253/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:882726/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:890977/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:923301/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:94046/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:94872/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:976616/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:987591/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1356424/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1034444/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1055094/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1063056/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1067091/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1123091/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1193170/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1216634/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1236717/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1280095/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1284885/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1316361/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1356038/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1007809/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1387440/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1389006/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:140291/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:1452804/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:244386/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:265870/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:300676/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:303195/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:303802/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:365206/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTAATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:570959/55‑1 (MQ=255) gAATGTCCGAATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTaa  <  1:2690/55‑1 (MQ=255) |                                                       GAATGTCCGGATGGCGAAATTTGGCTGATTAATCCTTTTAACGGTGAATCGTTAA  >  W3110S.gb/1269284‑1269338

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑