Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1291548	1291990	443	54 [0]	[0] 74	[rssA]–[rssB]	[rssA],[rssB]

ATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCA  >  W3110S.gb/1291991‑1292033 |                                           atatCGCGATGCCATGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:969808/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAGCGGGCGTAAACTGCTGGAGCa  >  1:51328/1‑43 (MQ=38) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGc   >  1:938007/1‑42 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:449244/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:663460/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:637776/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:582985/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:559065/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:554355/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:551212/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:510877/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:458519/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:699195/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:43779/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:3687/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:354361/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:326722/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:302195/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:298899/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1008252/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:818063/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:985320/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:968755/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:921002/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:899520/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:88736/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:856975/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:834301/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:824954/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:689617/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:759405/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:747855/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:7408/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:734823/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:712776/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:710033/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:274651/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1136410/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1292397/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1282449/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1275931/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1267433/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1247377/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1209368/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1187656/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1173437/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1293655/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1120365/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1119281/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1114130/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:111118/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1106699/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:109204/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1038438/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1019158/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1456617/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:249705/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:24314/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:222385/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:193699/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:168386/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1663/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1472458/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1460150/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:25764/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1456162/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1430518/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1416786/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1371882/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1355987/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1355109/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1326073/1‑43 (MQ=255) atatCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:1314106/1‑43 (MQ=255) atatCGAGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCa  >  1:95350/1‑43 (MQ=255) |                                           ATATCGCGATGCCACGAATGAACGGGCTTAAACTGCTGGAGCA  >  W3110S.gb/1291991‑1292033

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑