Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1377804	1378042	239	25 [0]	[0] 27	ycjR	hypothetical protein

CGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAC  >  W3110S.gb/1378043‑1378104 |                                                              cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTAccgccg                          >  1:102342/1‑38 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTAcagccg                          >  1:276740/1‑38 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGa   >  1:96246/1‑61 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGa   >  1:1258549/1‑61 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGa   >  1:1263881/1‑61 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGa   >  1:1318833/1‑61 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGa   >  1:240361/1‑61 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGa   >  1:1433947/1‑61 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:508027/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:256171/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:624858/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:646986/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:650715/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:652004/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:733741/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:758571/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:964058/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:492446/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:4074/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:394236/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1459731/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1398582/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1307346/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1307138/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1132679/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1130832/1‑62 (MQ=255) cGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAc  >  1:1038088/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGGCTGCGTGGGGCATGTTTACCTTCCGCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGAC  >  W3110S.gb/1378043‑1378104

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑