Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1378313	1378344	32	34 [0]	[0] 30	ycjR	hypothetical protein

CTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGC  >  W3110S.gb/1378345‑1378392 |                                                cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:288721/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:931676/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:824075/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:782716/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:703633/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:693593/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:602021/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:567981/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:444268/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:428880/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:402973/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:398660/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:371139/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:307319/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:100566/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:284636/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:222492/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:194887/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:182301/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:180839/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:144950/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:1420001/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:1396084/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:134734/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:1331749/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:1280684/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:1221333/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:1139921/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:1123329/48‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTCATGTGCATATCGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGc  <  1:369357/48‑1 (MQ=255) |                                                CTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGGATAACCATCGCTACCAGCCGGGC  >  W3110S.gb/1378345‑1378392

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑