Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1533570	1533583	14	22 [0]	[1] 54	ydcC	conserved hypothetical protein

AAGCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTC  >  W3110S.gb/1533582‑1533645   |                                                              aaGCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAtt    <  1:763030/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCTGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:180656/62‑1 (MQ=255)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:731262/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:365819/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:385035/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:475201/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:549617/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:555138/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:582662/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:628298/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:64935/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:655856/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:658928/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:668134/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:711761/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:360451/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:793150/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:840213/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:865558/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:882742/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:887865/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:914247/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:940054/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:941781/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:943160/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:986806/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:997260/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1326671/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1094742/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1136035/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1165412/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1168297/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1189666/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1220395/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1243541/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1259405/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1270500/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1270861/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:129065/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1307261/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1029595/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:138291/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1387944/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1400117/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:142004/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1425613/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1440126/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1452620/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:189966/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:216629/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:238763/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:249364/62‑1 (MQ=40)   gCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATAGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:1106397/62‑1 (MQ=255)   gCCTGGAAAATGGAACACAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc  <  1:582380/62‑1 (MQ=255)   |                                                              AAGCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTC  >  W3110S.gb/1533582‑1533645

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑