Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1546069	1546177	109	11 [0]	[0] 58	[yddJ]	[yddJ]

CGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATATT  >  W3110S.gb/1546178‑1546235 |                                                          cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:764030/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:331259/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:378511/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:421229/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:424086/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:430375/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:441304/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:446991/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:484744/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:549167/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:576910/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:603893/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:652637/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:739765/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:745496/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:325781/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:780968/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:792428/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:79657/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:823580/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:836091/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:884524/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:934073/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:938577/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:941686/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:958534/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:963262/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:964759/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:986456/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1360761/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1087077/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1099555/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1102532/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1137342/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1160017/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1176661/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:11932/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1195832/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1242715/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1289116/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1292226/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1308033/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1326918/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1340033/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1052930/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1369090/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:137687/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1377156/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1415750/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1461720/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:1470672/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:181929/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:18663/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:197039/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:211805/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:217082/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:264595/58‑1 (MQ=255) cGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATAtt  <  1:280900/58‑1 (MQ=255) |                                                          CGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATATT  >  W3110S.gb/1546178‑1546235

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑