Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1547286	1547370	85	44 [0]	[0] 31	yddK	hypothetical protein

CGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATATT  >  W3110S.gb/1547371‑1547431 |                                                             cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCatat   >  1:336867/1‑60 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1469353/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:944730/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:912808/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:888630/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:796956/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:781839/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:75589/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:672963/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:655634/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:530549/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:517876/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:505613/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:450401/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:376089/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:281065/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1038079/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1465303/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1384011/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1364222/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1347348/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1278872/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1277190/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1275043/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1261416/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1248923/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1186749/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1131551/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1110436/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1094983/1‑61 (MQ=255) cGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATAtt  >  1:1085809/1‑61 (MQ=255) |                                                             CGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATATT  >  W3110S.gb/1547371‑1547431

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑