Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1640413	1640637	225	14 [0]	[0] 9	cspI/ydfP	cold shock protein/conserved hypothetical protein

GACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATT  >  W3110S.gb/1640638‑1640698 |                                                             gACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTtttatt  <  1:1018286/61‑1 (MQ=255) gACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTtttatt  <  1:1240817/61‑1 (MQ=255) gACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTtttatt  <  1:1341408/61‑1 (MQ=255) gACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTtttatt  <  1:135411/61‑1 (MQ=255) gACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTtttatt  <  1:578529/61‑1 (MQ=255) gACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTtttatt  <  1:707695/61‑1 (MQ=255) gACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTtttatt  <  1:788559/61‑1 (MQ=255) gACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTtttatt  <  1:795425/61‑1 (MQ=255) gACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTtttatt  <  1:814895/61‑1 (MQ=255) |                                                             GACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATT  >  W3110S.gb/1640638‑1640698

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑