Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1654546	1654689	144	16 [0]	[0] 49	[ynfP]–[rspB]	[ynfP],[rspB]

GGAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTC  >  W3110S.gb/1654690‑1654750 |                                                             ggAAATCAAACTTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:599122/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTATCCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1109818/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:47996/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:253381/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:307772/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:314960/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:314996/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:315020/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:412810/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:413765/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:416385/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:420868/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:439939/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:45228/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:463998/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:225928/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:540551/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:546618/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:556722/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:693424/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:804664/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:841442/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:858184/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:941467/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:970095/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1266436/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1011720/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1036375/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1038097/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1062794/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1071023/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1104230/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1105338/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1163341/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1163431/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1179772/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1197761/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:24229/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1276536/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:128789/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1364793/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1412874/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1413109/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:149049/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:161468/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:177575/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1996/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:211512/61‑1 (MQ=255) ggAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTc  <  1:1002116/61‑1 (MQ=255) |                                                             GGAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTC  >  W3110S.gb/1654690‑1654750

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑