Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1657795	1657823	29	22 [0]	[0] 47	ynfB	hypothetical protein

CTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAT  >  W3110S.gb/1657824‑1657884 |                                                             cTGCCTGGAGCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1133578/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGTACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:676874/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTATCCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1144164/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:794743/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:501430/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:539955/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:554869/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:602345/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:634576/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:726093/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:735958/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:752245/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:770032/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:781383/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:785976/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:450259/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:812146/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:828629/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:832148/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:875750/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:881691/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:917457/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:919006/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:954040/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:954692/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1402764/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1059854/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1145652/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1150485/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1215207/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1258453/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1291740/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:132049/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1347074/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1359205/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1365237/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:466507/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1462377/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:239667/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:265779/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:273064/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:296767/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:308062/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:318232/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:365332/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:432993/61‑1 (MQ=255) cTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAt  <  1:1016395/61‑1 (MQ=255) |                                                             CTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAAT  >  W3110S.gb/1657824‑1657884

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑