Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1691566	1691856	291	16 [0]	[0] 7	ydgA	conserved hypothetical protein

CATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGATCCCGTCGATGGCATCAA  >  W3110S.gb/1691857‑1691917 |                                                             cATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGATCCCGTCGATGGCATCaa  <  1:1108421/61‑1 (MQ=255) cATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGATCCCGTCGATGGCATCaa  <  1:1132661/61‑1 (MQ=255) cATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGATCCCGTCGATGGCATCaa  <  1:1390786/61‑1 (MQ=255) cATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGATCCCGTCGATGGCATCaa  <  1:161161/61‑1 (MQ=255) cATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGATCCCGTCGATGGCATCaa  <  1:27537/61‑1 (MQ=255) cATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGATCCCGTCGATGGCATCaa  <  1:830651/61‑1 (MQ=255) cATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGATCCCGTCGATGGCATCaa  <  1:889597/61‑1 (MQ=255) |                                                             CATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGATCCCGTCGATGGCATCAA  >  W3110S.gb/1691857‑1691917

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑