Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1724958	1725141	184	31 [0]	[0] 54	ydhK	conserved inner membrane protein

TCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAT  >  W3110S.gb/1725142‑1725200 |                                                           tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACaa                 >  1:1132327/1‑44 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATg               >  1:99991/1‑46 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTaaa   >  1:1459325/1‑58 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTaaa   >  1:713972/1‑58 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:480285/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:102583/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:503160/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:54071/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:543566/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:552939/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:578608/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:585996/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:600552/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:608057/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:617595/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:733155/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:741604/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:746300/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:762003/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:788103/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:795476/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:854039/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:856382/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:856617/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:92/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:922948/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:979805/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:990320/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1380542/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1001837/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1042292/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1070934/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1090546/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:109912/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1130839/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1161562/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1167275/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1185937/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1203096/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1342262/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1360097/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1381096/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1381733/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:1457865/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:205504/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:21200/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:257586/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:268213/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:289059/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:337239/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:353661/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCGTCTTAAAt  >  1:1419647/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAACGCAGCTTCTTAAAt  >  1:440646/1‑59 (MQ=255) tCTGTGGCAATTTTTACTCTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAt  >  1:656643/1‑59 (MQ=255) |                                                           TCTGTGGCAATTTTTACTGTTTCTCTTTCCACTGCTGGCGACAATGCAGCTTCTTAAAT  >  W3110S.gb/1725142‑1725200

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑