Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1797123	1797186	64	32 [0]	[0] 43	ihfA	integration host factor (IHF), DNA‑binding protein, alpha subunit

ACCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCT  >  W3110S.gb/1797187‑1797223 |                                     aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:424392/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1472317/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:159762/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:170223/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:202971/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:242059/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:250656/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:296265/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:309093/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:381440/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:391560/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1463772/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:59439/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:677695/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:712559/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:742008/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:752896/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:819293/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:884730/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:950682/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:958615/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:969219/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1244986/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1038289/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1052495/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1081814/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:109041/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1122874/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1131955/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1151268/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:116457/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1170135/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1196393/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1010578/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1250262/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1274047/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:127604/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1290111/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:129416/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1314342/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1339135/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1379265/37‑1 (MQ=255) aCCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCt  <  1:1407399/37‑1 (MQ=255) |                                     ACCAGTTCTTTGGCATCCCGCTTGCTAAGCCCAAGCT  >  W3110S.gb/1797187‑1797223

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑