Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1953324	1953538	215	47 [0]	[0] 90	yecE	conserved hypothetical protein

AAACGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCG  >  W3110S.gb/1953539‑1953600 |                                                              aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCTCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:801451/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGGCAGCCGCCCg  <  1:421789/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACTGCCGCCCg  <  1:720722/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGTCGCCCg  <  1:1276246/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:486262/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:632622/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:631548/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:570968/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:543447/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:536468/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:502889/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:502250/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:496556/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:49381/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:696521/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:485976/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:468495/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:465856/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:454413/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:431643/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:405395/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:396101/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:39580/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:391623/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:388915/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:92033/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:975580/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:974480/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:970631/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:969250/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:961279/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:952094/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:933476/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:930700/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:923759/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:920522/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:691896/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:8790/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:868906/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:850294/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:846124/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:800688/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:791167/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:745626/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:718494/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:348998/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1245982/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1021990/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1346946/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1320179/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1318438/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1303734/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1301562/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1277138/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1273722/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1254819/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1250897/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1348350/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1242466/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1224777/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:120237/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:120069/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:116528/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1154383/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1101261/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1077901/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1068979/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1052818/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:221054/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:313060/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:309157/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:307012/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:294295/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:285284/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:266458/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:236393/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:232311/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:224375/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1352575/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:212378/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:18845/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:174737/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:17100/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:168697/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:167286/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:159152/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1401063/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:139782/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1393083/62‑1 (MQ=255) aaaCGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGGGATTTTAGACAGCCGCCCg  <  1:1214499/62‑1 (MQ=255) |                                                              AAACGCTTAATCGCGGTTTACATCAGCGCGGCGTTAATCGGGTGATTTTAGACAGCCGCCCG  >  W3110S.gb/1953539‑1953600

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑