Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2002471	2002488	18	41 [0]	[0] 26	fliY	cystine transporter subunit

TCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTT  >  W3110S.gb/2002489‑2002550 |                                                              tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCatat                            >  1:390133/1‑36 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCAc                        >  1:1334135/1‑40 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:287994/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:969189/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:834271/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:8034/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:625904/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:576655/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:534027/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:507714/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:40532/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:383316/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:350934/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:1079501/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:263924/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:241554/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:172943/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:166314/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:1446665/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:1362377/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:1353953/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:1266817/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:1117100/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:1116190/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGtt  >  1:1113722/1‑62 (MQ=255) tCAATGCCTGACGTCCAAGATGTGCTAATTTCATATTCAccc                      >  1:736548/1‑42 (MQ=255) |                                                              TCAATGCCTGACGTCCCAGATGTGCTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTT  >  W3110S.gb/2002489‑2002550

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑