Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2003654	2003771	118	29 [0]	[0] 36	fliA	RNA polymerase, sigma 28 (sigma F) factor

AACCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTG  >  W3110S.gb/2003772‑2003833 |                                                              aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:793770/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:495078/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:518444/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:602941/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:604081/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:62745/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:734139/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:763834/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:789315/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:43139/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:819653/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:852267/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:899019/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:915807/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:937479/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:944259/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:961135/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:992700/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:192591/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:1076243/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:1182725/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:132688/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:1346477/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:1382980/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:1409125/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:1455368/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:183213/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:1006941/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:236513/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:243705/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:320291/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:333199/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:356255/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:360022/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:377126/62‑1 (MQ=255) aaCCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTg  <  1:409377/62‑1 (MQ=255) |                                                              AACCCAATGCCGCCCGCCTGTAGCAGATCGTCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTG  >  W3110S.gb/2003772‑2003833

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑