Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2005508	2005559	52	58 [1]	[0] 38	fliC	flagellar filament structural protein

TCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCTT  >  W3110S.gb/2005560‑2005620 |                                                             tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:893851/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:556691/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:566091/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:610024/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:622091/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:63673/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:719323/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:810336/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:811307/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:886157/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:496839/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:90487/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:906340/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:914824/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:918321/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:928784/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:964918/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:982840/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:993403/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:1326604/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:1063001/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:1069999/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:1091742/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:1093469/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:1103470/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:1125506/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:1167276/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:1228234/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:1246254/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:103343/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:1392323/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:1431782/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:274594/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:301555/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:337193/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:38117/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:399969/61‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCtt  <  1:447682/61‑1 (MQ=255) |                                                             TCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCTT  >  W3110S.gb/2005560‑2005620

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑