Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2116587	2117076	490	87 [0]	[0] 49	[wcaM]	[wcaM]

GCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTCAC  >  W3110S.gb/2117077‑2117135 |                                                           gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:734280/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:443975/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:452874/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:453800/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:489256/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:490963/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:509509/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:547656/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:615768/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:680208/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:689586/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:717568/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:719880/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:353384/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:749338/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:782979/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:786588/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:804719/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:81024/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:822353/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:823046/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:834622/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:843023/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:967237/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:993972/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1442653/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1086497/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1146822/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1160928/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1191192/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1230262/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1257105/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1278036/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1301623/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1312401/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:137022/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1374791/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1064347/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1446613/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1455624/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:1458157/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:189102/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:247757/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:278850/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:336643/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:336813/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:346864/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:348669/59‑1 (MQ=255) gCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTcac  <  1:351447/59‑1 (MQ=255) |                                                           GCCGATTAACATCCCGGCGCTATTAATCATTTCAATATTATCAATCACGAAATTGTCAC  >  W3110S.gb/2117077‑2117135

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑