Missing coverage evidence...
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GCGTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAT  >  W3110S.gb/2138782‑2138842 |                                                             gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:421042/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:969266/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:963882/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:904576/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:883882/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:853613/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:828518/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:793906/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:738212/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:652123/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:63068/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:571795/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:520981/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:481397/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:460886/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:1019162/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:364700/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:278473/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:1458824/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:144832/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:1444672/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:1397784/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:1347329/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:1335384/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:1267046/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:1253215/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:1130193/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:1085679/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:104166/61‑1 (MQ=255) gcgTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGAGATCGCCTGTTGACCGGATTTAt  <  1:1181048/61‑1 (MQ=255) |                                                             GCGTTGATGGCGTCGAGAATAGTCAGTGGCACGTTGGTGATCGCCTGTTGACCGGATTTAT  >  W3110S.gb/2138782‑2138842

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑