Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2156935	2156947	13	26 [0]	[0] 48	mdtA	multidrug efflux system, subunit A

ACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGC  >  W3110S.gb/2156948‑2157006 |                                                           aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGt                      >  1:147286/1‑39 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:622308/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:392007/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:397138/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:409259/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:454175/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:464647/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:473344/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:481890/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:513159/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:560740/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:605403/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:384705/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:627010/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:642974/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:650597/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:725116/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:759273/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:771461/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:77167/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:771976/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:791282/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:808204/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:845393/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1392276/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1038166/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1054711/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1072219/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1095138/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1107672/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1203008/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1205694/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1334559/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1354022/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1388078/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1003927/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1430611/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:143210/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:188572/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:221622/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:235347/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:23767/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:273412/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:296295/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:325098/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:368629/1‑59 (MQ=255) aCCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATAGATGc  >  1:400313/1‑59 (MQ=255) aCCAACTAGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGc  >  1:1201279/1‑59 (MQ=255) |                                                           ACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGATGC  >  W3110S.gb/2156948‑2157006

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑