Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2164084	2164086	3	29 [0]	[0] 51	mdtD	multidrug efflux system protein

TGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCT  >  W3110S.gb/2164087‑2164148 |                                                              tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTgggg                            >  1:574779/1‑36 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTAt                       >  1:775196/1‑41 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGc   >  1:1190625/1‑61 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:234301/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:148802/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:24996/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:267467/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:284661/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:291719/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:293482/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:300577/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:443996/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:504852/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:510522/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:575133/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:663021/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:692920/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:706512/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:715830/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:725071/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:818547/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:845838/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:862834/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:884306/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:89507/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:934239/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1256852/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1020213/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:103905/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1043126/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1051339/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1051385/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1069212/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1093552/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1100779/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1115189/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1122384/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1149028/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1154464/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1271930/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1273936/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1279288/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1310787/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1312039/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1319974/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1395668/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1418220/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1434178/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1467386/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:1016406/1‑62 (MQ=255) tGGCACTGGATCTTTTTGATAAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt  >  1:211747/1‑62 (MQ=255) |                                                              TGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCT  >  W3110S.gb/2164087‑2164148

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑