Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2164196	2164748	553	8 [0]	[1] 31	mdtD	multidrug efflux system protein

TCCCGGACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAT  >  W3110S.gb/2164745‑2164805     |                                                         tcCCTGACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:878320/61‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1435251/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:99609/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:963463/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:846535/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:790612/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:739100/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:604932/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:556353/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:513719/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:38795/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:342889/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:326660/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:292046/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1469585/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:100637/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1391128/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1341440/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1301005/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1270853/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1253293/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1247369/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:124611/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1208190/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1131775/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1120062/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1114121/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1067159/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:1030899/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:102610/57‑1 (MQ=255)     ggACAATCTAGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAt  <  1:390802/57‑1 (MQ=255)     |                                                         TCCCGGACAATCTGGCGAGCAGCGGCAACAGCCTGCTGTCGATGATTATGCAATTGTCGAT  >  W3110S.gb/2164745‑2164805

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑