Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2216125	2216221	97	28 [0]	[0] 27	yehT	predicted response regulator in two‑component system withYehU

GCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCATCATC  >  W3110S.gb/2216222‑2216275 |                                                      gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:378143/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:929066/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:886763/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:875141/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:871223/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:816867/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:703598/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:630195/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:621553/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:546888/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:518558/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:458760/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:414647/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:1015567/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:352887/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:278754/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:21579/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:173449/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:1453310/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:1423473/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:1243427/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:1234194/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:1172380/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:1164871/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:1090726/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCatcatc  <  1:1087764/54‑1 (MQ=255) gCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTCCTAACGGTTCatcatc  <  1:666812/54‑1 (MQ=255) |                                                      GCTCTGCTCCTGCAAAAATACACGCAGGTTCTCCCGTGCTAACGGTTCATCATC  >  W3110S.gb/2216222‑2216275

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑