Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2318225	2318331	107	18 [1]	[0] 59	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

GGCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACG  >  W3110S.gb/2318332‑2318393 |                                                              ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCTAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:810561/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTTCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:544432/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:753308/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:56254/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:564986/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:565952/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:568832/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:589588/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:606625/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:612267/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:634077/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:677352/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:69105/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:691926/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:69538/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:709901/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:982843/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:807908/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:824191/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:825467/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:829303/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:836770/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:860013/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:882798/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:884654/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:901059/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:916183/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:921735/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:962320/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1075046/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:178520/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1076035/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1115549/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1141049/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1173866/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1176331/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1220346/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1243048/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1308331/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1360191/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1407714/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1417619/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1422382/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:14291/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:1455066/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:550821/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:207899/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:220563/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:263470/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:318359/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:335370/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:366068/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:368326/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:413581/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:5014/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:501852/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:525901/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACg  >  1:538129/1‑62 (MQ=255) ggCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCT‑GAAAAGTGAGACg  >  1:352791/1‑61 (MQ=255) |                                                              GGCTGGTTGATGAAATACAGTTAGCGAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACG  >  W3110S.gb/2318332‑2318393

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑