Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb699,3870TC71.0% 218.8 / 107.0 200V71V (GTA→GTG) asnBasparagine synthetase B
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (58/0);  new base C (0/142);  total (58/142)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.04e-01
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 200 total aligned reads displayed.

CGCAATGCCTGGTGGTTGTAGATTTCACCGTTTACCGCCAGTACGTGGGTTTTTTGTTGGT  >  W3110S.gb/699346‑699406
                                         |                   
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          ggtggtTGTAGATTTCACCGTTTACTTCCAGCACATga               <  1:758080/38‑2 (MQ=16)
                                         |                   
CGCAATGCCTGGTGGTTGTAGATTTCACCGTTTACCGCCAGTACGTGGGTTTTTTGTTGGT  >  W3110S.gb/699346‑699406

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑