Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 611,493 T→A P75P (CCA→CCT)  fepA ← iron‑enterobactin outer membrane transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb611,4930TA100.0% 263.8 / NA 94P75P (CCA→CCT) fepAiron‑enterobactin outer membrane transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base A (94/0);  total (94/0)

Only 100 of 153 total aligned reads displayed.

TATCAATCTGTCGGTTATTCCCACGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCTGGCATGG  >  W3110S.gb/611432‑611500
                                                             |       
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tatCAATCTGTCGGTTATTCCCACGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCt         >  1:1445765/1‑62 (MQ=255)
tatCAATCTGTCGGTTATTCCCACGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCt         >  1:1179300/1‑62 (MQ=255)
tatCAATCTGTCGGTTATTCCCACGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCt         >  1:1441142/1‑62 (MQ=255)
tatCAATCTGTCGGTTATTCCCACGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCt         >  1:1184025/1‑62 (MQ=255)
tatCAATCTGTCGGTTATTCCCACGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCt         >  1:1126305/1‑62 (MQ=255)
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                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:574365/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:656294/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:640381/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:611622/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:597332/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:588809/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:741865/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:1205814/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:564744/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:559918/1‑46 (MQ=255)
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                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:1106706/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:875724/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:902619/1‑46 (MQ=255)
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                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:280630/1‑46 (MQ=255)
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                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:1328388/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:1334220/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:406061/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:387027/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:1336727/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:350658/1‑46 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATg   >  1:231985/1‑45 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATg   >  1:979345/1‑45 (MQ=255)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACG‑CAGGCATgg  >  1:430160/1‑45 (MQ=38)
                       cGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGCTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:156420/1‑46 (MQ=39)
                       cGCTGACAACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCAGGCATgg  >  1:484451/1‑46 (MQ=255)
                                                             |       
TATCAATCTGTCGGTTATTCCCACGCTGACCACTGGTGGAGTTACCGGTCAGGTTAACGCCTGGCATGG  >  W3110S.gb/611432‑611500

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑