Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	711,161	C→T	intergenic (‑93/+196)	fur ← / ← fldA	DNA‑binding transcriptional dual regulator/flavodoxin 1

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	711,161	0	C	T	100.0%	109.7 / NA	41	intergenic (‑93/+196)	fur/fldA	DNA‑binding transcriptional dual regulator/flavodoxin 1
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/41);  total (0/41)

GCCACGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCAAA  >  W3110S.gb/711157‑711192     |                                gCCATGCCTAAATGAAATCCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:896158/36‑1 (MQ=37) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:753922/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1448723/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:15555/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:18564/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:260955/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:342076/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:421895/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:425098/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:486799/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:680624/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:72137/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1407777/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:7722/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:772238/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:806100/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:813958/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:831510/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:833588/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:927143/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:979420/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1277432/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1036063/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1076083/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1103967/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1126972/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1240790/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1264089/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1268595/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1276359/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1017066/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1309054/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1314936/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1320184/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1337305/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:134078/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1344301/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1355193/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1377215/36‑1 (MQ=255) gCCATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1395567/36‑1 (MQ=255)  ccATGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCaaa  <  1:1171144/35‑1 (MQ=255)     |                                GCCACGCCTAAATGAAAACCACAAGTCCCTGGCAAA  >  W3110S.gb/711157‑711192

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑