Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 839,216 T→C G138G (GGA→GGG ybiX ← conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb839,2160TC100.0% 223.0 / NA 78G138G (GGA→GGGybiXconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/78);  total (0/78)

GCTGCTGGAGGGATACAACACGAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGTCCGAAGG  >  W3110S.gb/839162‑839223
                                                      |       
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGTAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1071043/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGaatg  <  1:1468605/62‑3 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:399048/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:532813/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:504426/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:475015/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:45183/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:436309/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:432648/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:407854/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:400669/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:399959/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:544893/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:396829/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:386122/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:385084/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:376556/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:334634/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:333654/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1007205/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:71579/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:980527/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:962899/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:928782/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:859479/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:850023/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:827442/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:812633/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:73506/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:319661/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:704279/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:689544/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:687664/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:654740/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:639571/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:598609/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:594687/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:557455/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1109470/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1254217/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:313764/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1203978/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1187014/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1171965/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1165071/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1153959/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1117212/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:111466/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1241031/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1103956/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1059460/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1057694/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1054275/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1048422/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1021689/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1018524/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:10161/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1428192/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:306056/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:302486/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:28672/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:251655/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:250528/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:220603/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:214165/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1467487/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1433540/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1259604/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1413112/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1377551/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:131106/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1269861/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:126634/62‑1 (MQ=255)
gctgctGGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:1264160/62‑1 (MQ=255)
 ctgctgGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:633559/61‑1 (MQ=255)
 ctgctgGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:927180/61‑1 (MQ=255)
 ctgctgGAGGGATACAACACCAGATCGCCTGCCGGGAGGTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:429002/61‑1 (MQ=255)
                          cGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGCCCGAAgg  <  1:578882/36‑1 (MQ=255)
                                                      |       
GCTGCTGGAGGGATACAACACGAGATCGCCTGCCGGGAGTTTTACCCGATGTTGTCCGAAGG  >  W3110S.gb/839162‑839223

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: