Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	899,600	T→C	L221L (TTG→CTG)	rumB →	23S rRNA m(5)U747 methyltransferase

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	899,600	0	T	C	100.0%	122.2 / NA	44	L221L (TTG→CTG)	rumB	23S rRNA m(5)U747 methyltransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (44/0);  total (44/0)

CCAGTTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATC  >  W3110S.gb/899596‑899657     |                                                          ccagCTGTACGCCCCCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGAt   >  1:442686/1‑61 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGTTTAAACATATGTGGGATc  >  1:16865/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATAtgt        >  1:1114233/1‑56 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGAt   >  1:1009038/1‑61 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGAt   >  1:1467796/1‑61 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGAt   >  1:59606/1‑61 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGAt   >  1:12966/1‑61 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:348560/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:251233/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:383502/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:395121/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:430870/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:541020/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:567098/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:582001/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:597309/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:602814/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:605875/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:646681/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:651599/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:686472/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:744065/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:767007/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:930965/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:962143/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:1232647/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:1030060/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:1040437/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:1116531/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:1154646/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:1165438/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:1185687/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:1190122/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:1201219/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:1227690/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:324100/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:1358423/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:161183/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:201454/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:203329/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:240753/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:24840/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:25907/1‑62 (MQ=255) ccagCTGTACGCCACCGAGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATc  >  1:1247279/1‑62 (MQ=255)     |                                                          CCAGTTGTACGCCACCGCGCGCGACTGGGTACGACAGCTGCCGGTTAAACATATGTGGGATC  >  W3110S.gb/899596‑899657

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑