Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,151,641 C→T L113L (CTG→TTG)  fabD → malonyl‑CoA‑[acyl‑carrier‑protein] transacylase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,151,6410CT100.0% 384.4 / NA 136L113L (CTG→TTG) fabDmalonyl‑CoA‑[acyl‑carrier‑protein] transacylase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/136);  total (0/136)

Only 100 of 136 total aligned reads displayed.

TGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCG  >  W3110S.gb/1151615‑1151677
                          |                                    
taattgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCG‑GGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:50922/60‑1 (MQ=255)
taattgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCG‑GGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:121253/60‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTTAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1342754/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGGAGCCg  <  1:1063424/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:599896/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:742685/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:73671/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:730449/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:709508/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:707305/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:697161/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:669715/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:663574/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:660583/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:651295/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:774797/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:571567/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:546307/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:54177/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:50639/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:49590/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:488920/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:480929/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:412969/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:390843/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1001159/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:910478/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:999259/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:998926/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:986603/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:978825/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:977794/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:970102/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:964777/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:962939/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:953451/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:949547/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:912570/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:760324/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:898075/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:889815/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:870687/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:85247/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:848702/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:831297/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:82873/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:794498/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:793297/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:363467/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1128461/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1345624/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1329911/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1278636/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1271723/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1251332/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:121662/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1198869/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1181195/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1165408/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1142534/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1311675/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1106861/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1097659/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1084762/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1065336/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1055468/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1046865/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:102320/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1021635/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1009907/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1009743/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:189524/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:342080/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:332819/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:326522/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:320216/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:309617/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:29980/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:290579/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:274352/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:266553/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:225766/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:204456/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1352448/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:179201/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1433719/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1430592/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1430248/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1379478/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1375694/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATCCAAGAAGCCg  <  1:353109/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAATTCATGCAAGAAGCCg  <  1:445333/61‑1 (MQ=255)
  attgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGCCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:950419/61‑1 (MQ=255)
   ttgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAGGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:184676/60‑1 (MQ=255)
   ttgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGcct  <  1:1247976/60‑2 (MQ=255)
   ttgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:860264/60‑1 (MQ=255)
   ttgattTCGCTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:788163/60‑1 (MQ=255)
            cTGATGCGGTGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:861941/51‑1 (MQ=255)
                     tGCGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:263696/42‑1 (MQ=255)
                       cGTTTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCg  <  1:1261390/40‑1 (MQ=255)
                          |                                    
TGATTGATTTCGCTGATGCGGTGCGTCTGGTTGAGATGCGCGGCAAGTTCATGCAAGAAGCCG  >  W3110S.gb/1151615‑1151677

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑