Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,160,980	T→C	T717A (ACA→GCA)	fhuE ←	ferric‑rhodotorulic acid outer membrane transporter

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,160,980	0	T	C	100.0%	128.4 / NA	46	T717A (ACA→GCA)	fhuE	ferric‑rhodotorulic acid outer membrane transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/46);  total (0/46)

GATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGTGCCGTAGACGATAG  >  W3110S.gb/1160947‑1160994                                  |               gATACGTTCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:22637/48‑1 (MQ=39) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCTCCGTAGACGATAg  <  1:863209/48‑1 (MQ=39) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:784720/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:270203/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:274255/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:361893/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:361945/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:382887/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:420827/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:43677/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:562050/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:705061/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:740625/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:255084/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:793201/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:796293/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:817397/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:867516/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:89559/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:897236/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:908927/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:927645/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:989533/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1402920/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1052304/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1068213/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1115579/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1126307/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1196909/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1258469/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:13322/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1369293/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1390149/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1390816/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1024535/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1413471/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1416043/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1426441/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:143346/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1459223/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:188505/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:191729/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:197304/48‑1 (MQ=255) gATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:245721/48‑1 (MQ=255)  aTACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:1183862/47‑1 (MQ=255)  aTACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGCGCCGTAGACGATAg  <  1:334195/47‑1 (MQ=255)                                  |               GATACGTGCCGGTAATGCTGAAATTACGCGGTGTGCCGTAGACGATAG  >  W3110S.gb/1160947‑1160994

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑