| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 1,186,563 | A→G | F203F (TTT→TTC) | potA ← | polyamine transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 1,186,563 | 0 | A | G | 99.2% | 353.8 / ‑5.1 | 124 | F203F (TTT→TTC) | potA | polyamine transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (123/0); minor base T (1/0); total (124/0) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GGTCGTGAGTCACAAAGACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTC > W3110S.gb/1186550‑1186611 | ggTCGTGAGTTACTAACACGAATGTAATGCCAAGCtt > 1:861522/1‑37 (MQ=37)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGtt > 1:922866/1‑61 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGt > 1:795462/1‑60 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:397224/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:680192/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:624710/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:569807/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:526486/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:521426/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:504847/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:49998/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:464934/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:464103/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:416691/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:398697/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:695817/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:387600/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:383864/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:360408/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:353995/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:339306/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:30557/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:286959/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:283114/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:272430/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:270371/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1006227/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:871421/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:989454/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:987210/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:986354/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:98186/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:945319/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:934661/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:926346/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:907427/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:897846/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:896900/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:891139/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:685303/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:854780/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:851701/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:837868/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:783016/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:777221/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:744222/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:728510/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:723979/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:717277/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:257534/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1178868/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1276137/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1268720/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1268053/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:126201/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1255712/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1247399/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1240053/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1236073/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1235893/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1208329/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1206448/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1204302/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:225473/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1163286/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:116232/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1156278/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:115025/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:111920/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1116567/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1102207/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1088916/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1074817/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1065042/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1032768/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1302042/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:206245/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:205700/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:190507/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:188315/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:185430/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1457053/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1453481/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1424776/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1423423/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1406751/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1383937/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1370113/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1368083/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1364089/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1337196/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1326112/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1325201/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1305168/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1304334/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:1283222/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGATc > 1:443369/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGATc > 1:191297/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCCAAGCTTAAGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:226719/1‑62 (MQ=255)ggTCGTGAGTTACGAACACGAATGTAATGCAAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTc > 1:101491/1‑62 (MQ=255) | GGTCGTGAGTCACAAAGACGAATGTAATGCCAAGCTTACGCTGTAACGCTTTCAGCTCGTTC > W3110S.gb/1186550‑1186611 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |