Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,294,922 A→G intergenic (‑423/‑182) hns ← / → tdk global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,294,9220AG100.0% 306.8 / NA 107intergenic (‑423/‑182)hns/tdkglobal DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (107/0);  total (107/0)

Only 100 of 107 total aligned reads displayed.

AAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAT  >  W3110S.gb/1294903‑1294963
                   |                                         
gaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:858989/2‑61 (MQ=255)
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aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCtt                         >  1:1070254/1‑38 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATACCAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:990987/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGt        >  1:85917/1‑55 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGt     >  1:663331/1‑58 (MQ=255)
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aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:465638/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:426901/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:444668/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:458814/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:601445/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:468787/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:473303/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:50252/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:550352/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:576200/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:635192/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:418921/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:417598/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:403603/1‑61 (MQ=255)
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aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:739135/1‑61 (MQ=255)
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aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:260304/1‑61 (MQ=255)
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aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:1164490/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:1152691/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:1139407/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:1280053/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:1125489/1‑61 (MQ=255)
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aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:109927/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:1097847/1‑61 (MQ=255)
aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:1096185/1‑61 (MQ=255)
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aaGATTGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTA‑CCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAt  >  1:1451957/1‑60 (MQ=255)
aaGAATGTGAATAGTTACCGGCAGTCATTTACACGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTaa   >  1:301940/1‑60 (MQ=255)
                   |                                         
AAGATTGTGAATAGTTACCAGCAGTCATTTACCCGCTTATAACAAGCGAGGCAGTTGTAAT  >  W3110S.gb/1294903‑1294963

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑