Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	96,598	C→T	G199G (GGC→GGT)	mraY →	phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide transferase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	96,598	0	C	T	100.0%	92.2 / NA	35	G199G (GGC→GGT)	mraY	phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide transferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (35/0);  total (35/0)

GACGGCCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGG  >  W3110S.gb/96593‑96653      |                                                        gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGc                            >  1:1460749/1‑35 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGc                            >  1:86678/1‑35 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:731878/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:365951/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:426937/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:519638/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:5277/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:593325/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:593558/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:713979/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:270352/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:747558/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:781433/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:794659/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:826754/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:982466/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:9860/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:99519/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1232506/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1021034/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1024261/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1053279/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1069811/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1146627/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1154427/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1159578/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1228497/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:289705/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1235809/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:124491/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1259922/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:129164/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1395177/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:1452377/1‑61 (MQ=255) gACGGTCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTggg  >  1:100380/1‑61 (MQ=255)      |                                                        GACGGCCTGGCAATTATGCCGACCGTATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGG  >  W3110S.gb/96593‑96653

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑