Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	1,339,662	C→T	Y706Y (TAC→TAT)	acnA →	aconitate hydratase 1

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*	W3110S.gb	1,339,662	0	C	T	100.0%	209.3 / NA	75	Y706Y (TAC→TAT)	acnA	aconitate hydratase 1
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/75);  total (0/75)

AGGTCGGGGTGTTGAGCGAAAAGACTTTAACTCCTACGGTTCGCGGCGTGGTAACCATG  >  W3110S.gb/1339626‑1339684                                     |                       aGGTCGGGGTGTTGAGCGGAAAGACTTTAACTCCTATGGTTCGCGGCGTGGTAACCATg  <  1:581442/59‑1 (MQ=255) aGGTCGGGGTGTTGAGCGGAAAGACTTTAACTCCTATGGTTCGCGGCGTGGTAACCATg  <  1:71252/59‑1 (MQ=255) aGGTCGGGGTGTTGAGCGGAAAGACTTTAACTCCTATGGTTCGCGGCGTGGTAACCATg  <  1:705173/59‑1 (MQ=255) aGGTCGGGGTGTTGAGCGGAAAGACTTTAACTCCTATGGTTCGCGGCGTGGTAACCATg  <  1:679445/59‑1 (MQ=255) aGGTCGGGGTGTTGAGCGGAAAGACTTTAACTCCTATGGTTCGCGGCGTGGTAACCATg  <  1:653994/59‑1 (MQ=255) aGGTCGGGGTGTTGAGCGGAAAGACTTTAACTCCTATGGTTCGCGGCGTGGTAACCATg  <  1:64512/59‑1 (MQ=255) aGGTCGGGGTGTTGAGCGGAAAGACTTTAACTCCTATGGTTCGCGGCGTGGTAACCATg  <  1:623109/59‑1 (MQ=255) aGGTCGGGGTGTTGAGCGGAAAGACTTTAACTCCTATGGTTCGCGGCGTGGTAACCATg  <  1:615467/59‑1 (MQ=255) aGGTCGGGGTGTTGAGCGGAAAGACTTTAACTCCTATGGTTCGCGGCGTGGTAACCATg  <  1:607749/59‑1 (MQ=255) 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                                    |                       AGGTCGGGGTGTTGAGCGAAAAGACTTTAACTCCTACGGTTCGCGGCGTGGTAACCATG  >  W3110S.gb/1339626‑1339684

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑