Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,485,314 G→A A161A (GCG→GCA)  hrpA → ATP‑dependent helicase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,485,3140GA100.0% 413.4 / NA 147A161A (GCG→GCA) hrpAATP‑dependent helicase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (147/0);  total (147/0)

Only 100 of 147 total aligned reads displayed.

TAAGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCGGAGATCCAGCAA  >  W3110S.gb/1485265‑1485326
                                                 |            
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGCTGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCa   >  1:701891/3‑61 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGc    >  1:931527/3‑60 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGc    >  1:907397/3‑60 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGc    >  1:1098044/3‑60 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGc    >  1:470233/3‑60 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:499921/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:672585/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:665835/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:655046/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:647244/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:641909/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:634946/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:63436/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:612226/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:605324/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:559555/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:52758/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:510133/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:371501/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:459902/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:454772/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:448193/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:43708/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:402769/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:383432/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1018648/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:375974/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:823148/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:955442/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:954885/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:924716/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:90959/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:892962/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:887541/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:879726/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:86023/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:839450/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:837636/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:683054/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:817852/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:816674/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:808681/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:790643/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:755834/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:747240/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:736954/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:724092/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:703993/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:690561/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1179404/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1332414/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:355448/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1312260/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:130555/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:128743/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1281457/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:12762/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1263937/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1224008/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1210507/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1181992/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1316328/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1152157/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1147836/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1124420/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1110596/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1088511/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1071924/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1062497/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:10456/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1038586/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:103043/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:169801/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:27696/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:266239/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:294755/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:231209/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:221736/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1343300/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:30075/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:209488/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:171556/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1449565/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1432701/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:312286/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:313047/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1393252/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1373467/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:1362328/3‑62 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCa   >  1:1193876/3‑61 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCa   >  1:376109/3‑61 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCa   >  1:1095161/3‑61 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCa   >  1:345147/3‑61 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCa   >  1:243756/3‑61 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCa   >  1:491389/3‑61 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCa   >  1:1209290/3‑61 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCa   >  1:735475/3‑61 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCa   >  1:143154/3‑61 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCa   >  1:1346704/3‑61 (MQ=255)
tcaGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGCATCCTGCTGGCAGAGATCCAGCaa  >  1:723746/3‑62 (MQ=255)
                                                 |            
TAAGTGATAACACGATGGTCAAGCTGATGACCGACGGTATCCTGCTGGCGGAGATCCAGCAA  >  W3110S.gb/1485265‑1485326

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑