Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 158,860 A→T P89P (CCT→CCA)  pcnB ← poly(A) polymerase I

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb158,8600AT100.0% 400.5 / NA 144P89P (CCT→CCA) pcnBpoly(A) polymerase I
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (144/0);  total (144/0)

Only 100 of 144 total aligned reads displayed.

ACCCACCAGGCGGCAGTTACGGAACAGTTTGCGCACCTGCTCAGGCGTGGCGTTAGTGGTTA  >  W3110S.gb/158818‑158879
                                          |                   
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aCCCACCAGGCGGCAGTTACGGAACAGTTTGCGCACCTGCTCTGGCGTGGCGTTggtggtc   >  1:963469/1‑60 (MQ=255)
                                          |                   
ACCCACCAGGCGGCAGTTACGGAACAGTTTGCGCACCTGCTCAGGCGTGGCGTTAGTGGTTA  >  W3110S.gb/158818‑158879

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑