Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	1,705,483	A→G	H180H (CAT→CAC)	ydgJ ←	predicted oxidoreductase

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,705,483	0	A	G	98.9%	250.2 / ‑5.5	89	H180H (CAT→CAC)	ydgJ	predicted oxidoreductase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (1/0);  new base G (88/0);  total (89/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01

CAAATCTACCGTCATGCTGACCGGTAAACCAAAAAGCGTAATGGCCTGATCAAGAAGATGTGGTGCTA  >  W3110S.gb/1705426‑1705493                                                          |           cAAATCTACCGTCATGCTGACCGGTAAACCAAAAAGCGTAATGGCCTGATCAAGAAGAtag         >  1:987211/1‑59 (MQ=255)       tACCGTTATGCTAACCGGTAAACCAAATAACGTAATGGCCTGATCAAGAAGGTGCGGTGCTa  >  1:213961/1‑62 (MQ=255)       tACCGTGATGCTAACCGGTAAACCAAATAACGTAATGGCCTGATCAAGAAGGTGCGGTGCTa  >  1:736020/1‑62 (MQ=255)       tACCGTCATGCTAGCCGGTAAACCAAATAACGTAATGGCCTGATCAAGAAGGTGCGGTGCTa  >  1:1308165/1‑62 (MQ=255)       tACCGTCATGCTAACCGGTAAACCAAATAACGTAATGGCCTGATCAAGAAggtgcggtgcaa  >  1:83792/1‑60 (MQ=255)       tACCGTCATGCTAACCGGTAAACCAAATAACGTAATGGCCTGATCAAGAAggtgcggtgcaa  >  1:85529/1‑60 (MQ=255)       tACCGTCATGCTAACCGGTAAACCAAATAACGTAATGGCCTGATCAAGAAGGTgcggtg     >  1:304881/1‑59 (MQ=255)       tACCGTCATGCTAACCGGTAAACCAAATAACGTAATGGCCTGATCAAGAAGGTGCGGTGCt   >  1:236867/1‑61 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑