Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,708,728 A→G T32T (ACA→ACG)  rsxC → fused predicted 4Fe‑4S ferredoxin‑type protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,708,7280AG100.0% 321.0 / NA 112T32T (ACA→ACG) rsxCfused predicted 4Fe‑4S ferredoxin‑type protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (112/0);  total (112/0)

Only 100 of 112 total aligned reads displayed.

GATGAAAACCCAGTCCAACGGTACACCCCTGCGCCAGGTAC  >  W3110S.gb/1708704‑1708744
                        |                
gaTGAAAACCCAGTCCAACTGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1279061/1‑41 (MQ=38)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAg      >  1:15280/1‑37 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTa   >  1:916974/1‑40 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTa   >  1:63569/1‑40 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTa   >  1:138426/1‑40 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:498026/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:619981/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:57962/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:5784/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:561630/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:544101/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:543546/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:51412/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:51267/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:507551/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:632240/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:4649/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:46028/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:452578/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:439949/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:436876/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:400500/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:397513/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:385980/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:350701/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:350501/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:34732/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:738337/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:961280/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:93531/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:902289/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:882005/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:874343/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:849787/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:818275/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:773881/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:760313/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:745941/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:744300/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:620873/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:731496/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:726713/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:724079/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:712988/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:706022/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:700841/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:69951/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:66771/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:649106/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:323206/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:630201/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1142935/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1280656/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1265036/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1261992/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1253906/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1246888/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1242819/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1231541/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1199484/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1179315/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1160469/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1151777/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1316290/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1140669/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1123172/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1111258/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:109172/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1064536/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1057890/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1057036/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1056482/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1034789/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1031341/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1028369/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:185392/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:268975/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:261334/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:257730/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:257047/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:250872/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:250053/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:249261/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:244979/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:234900/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:22925/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:101040/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:165285/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:156414/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:151439/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1444002/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1394768/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1385567/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1379342/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1372042/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1326862/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1319650/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGGTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:1318096/1‑41 (MQ=255)
gaTGAAAACCCAGTCCAACGCTACGCCCCTGCGCCAGGTAc  >  1:420513/1‑41 (MQ=38)
gaTGAAAACCCAGACCAACGGTACGCCCCTGCGCCAgg     >  1:845487/1‑38 (MQ=38)
                        |                
GATGAAAACCCAGTCCAACGGTACACCCCTGCGCCAGGTAC  >  W3110S.gb/1708704‑1708744

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑