Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,741,437	G→A	L26L (CTG→TTG)	ydhB ←	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,741,437	0	G	A	100.0%	98.9 / NA	37	L26L (CTG→TTG)	ydhB	predicted DNA‑binding transcriptional regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/37);  total (0/37)

GGAACGCGATGCAGCTCCTGTGCCGCAGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATCAAC  >  W3110S.gb/1741424‑1741485              |                                                 ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:1024578/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:977889/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:976230/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:945979/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:933088/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:92250/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:877113/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:820055/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:775709/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:773971/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:764082/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:71461/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:605035/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:603150/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:531082/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:502059/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:330289/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:1024490/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:1057697/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:1112960/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:125585/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:1417850/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:1437615/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:1461644/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:189031/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:247231/62‑1 (MQ=255) ggAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:443221/62‑1 (MQ=255)  gAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:722430/61‑1 (MQ=255)  gAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:773858/61‑1 (MQ=255)  gAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:684713/61‑1 (MQ=255)  gAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:654797/61‑1 (MQ=255)  gAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:1209706/61‑1 (MQ=255)  gAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:1206277/61‑1 (MQ=255)  gAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:315695/61‑1 (MQ=255)  gAACGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:558254/61‑1 (MQ=255)   aaCGCGATGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:174833/60‑1 (MQ=255)         aTGCAACTCCTGGGCCGCGGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATcaac  <  1:686699/54‑1 (MQ=255)              |                                                 GGAACGCGATGCAGCTCCTGTGCCGCAGCGCTAAAACTACCATTACGCGCTACCGCATCAAC  >  W3110S.gb/1741424‑1741485

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑