Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,844,570	C→T	T162T (ACC→ACT)	gdhA →	glutamate dehydrogenase, NADP‑specific

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,844,570	0	C	T	100.0%	179.2 / NA	65	T162T (ACC→ACT)	gdhA	glutamate dehydrogenase, NADP‑specific
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/65);  total (0/65)

GATACCGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGGGTTGGT  >  W3110S.gb/1844565‑1844600      |                               gATACTGACGTTCCTGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1249143/36‑1 (MQ=25) gATACTGACGTTCCGGCATGTGATATCGGCGTtggt  <  1:681973/36‑1 (MQ=25) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCggtggt  <  1:276870/36‑1 (MQ=25) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:712685/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:727729/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:696424/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:688253/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:684771/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:682981/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:669952/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:637492/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:630287/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:630012/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:597351/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:567101/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:55010/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:44182/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:712981/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:367156/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:728019/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:75441/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:764799/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:793686/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:79504/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:816184/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:837012/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:864970/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:882133/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:902399/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:916237/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:916993/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:921535/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:933581/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1448739/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1065123/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1067708/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1088203/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1141252/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1152664/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1168044/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1202768/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:125193/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1259264/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1266024/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1277146/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1329667/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1362086/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1388788/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1395251/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:381842/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1465656/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1467006/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:191618/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:204061/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:222103/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:262150/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:265494/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:292189/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:319478/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:330512/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:34184/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:351432/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:1005812/36‑1 (MQ=37) gATACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggc  <  1:1471989/36‑2 (MQ=37)  aTACTGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGCGTtggt  <  1:486285/35‑1 (MQ=37)      |                               GATACCGACGTTCCGGCAGGTGATATCGGGGTTGGT  >  W3110S.gb/1844565‑1844600

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑