Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,878,169	A→T	A261A (GCA→GCT)	yeaN →	predicted transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,878,169	0	A	T	100.0%	139.9 / NA	51	A261A (GCA→GCT)	yeaN	predicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (0/51);  total (0/51)

CACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCA  >  W3110S.gb/1878135‑1878187                                   |                   cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:729596/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:364126/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:372101/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:378729/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:422885/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:42443/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:558593/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:610458/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:617399/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:643136/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:652661/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:674570/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:694467/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:265048/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:731707/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:741200/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:786777/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:790776/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:813117/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:838663/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:896586/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:922586/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:956629/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:979962/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:995599/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:997485/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1339926/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1051072/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1108291/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1116938/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1123374/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:114699/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1148141/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1194441/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1194518/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1268418/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1269959/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1271067/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1299809/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1011572/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1344181/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1405220/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:1450597/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:14573/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:149768/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:152199/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:154813/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:158303/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:166679/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:203253/53‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCTCCCGGTTTGCTGATCCCa  <  1:229242/53‑1 (MQ=255)                                   |                   CACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCA  >  W3110S.gb/1878135‑1878187

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑