Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 202,631 A→T A24A (GCA→GCT)  lpxA → UDP‑N‑acetylglucosamine acetyltransferase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb202,6310AT100.0% 338.1 / NA 122A24A (GCA→GCT) lpxAUDP‑N‑acetylglucosamine acetyltransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (122/0);  total (122/0)

Only 100 of 122 total aligned reads displayed.

CGCGAACGCACACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTA  >  W3110S.gb/202622‑202683
         |                                                    
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTg                             >  1:33328/1‑35 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGAcccc                       >  1:56471/1‑41 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGAcc                         >  1:2519/1‑39 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGt                   >  1:1081278/1‑45 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTgg          >  1:1007841/1‑54 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAgg     >  1:39933/1‑59 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGt   >  1:1029631/1‑61 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGt   >  1:1336315/1‑61 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGt   >  1:1286652/1‑61 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGt   >  1:1216160/1‑61 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGt   >  1:845090/1‑61 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGt   >  1:983004/1‑61 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:569678/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:677378/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:662528/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:626746/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:626165/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:62373/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:446869/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:606037/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:596485/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:523332/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:987538/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:566426/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:470414/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:4940/1‑62 (MQ=255)
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cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:507033/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:540201/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:53239/1‑62 (MQ=255)
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cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:834678/1‑62 (MQ=255)
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cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:767252/1‑62 (MQ=255)
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cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:729792/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:709284/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:704899/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:70301/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:684646/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:681113/1‑62 (MQ=255)
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cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:1429244/1‑62 (MQ=255)
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cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:1365481/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:1325070/1‑62 (MQ=255)
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cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:1263339/1‑62 (MQ=255)
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cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:1229805/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:1209966/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:156454/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:1171052/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:1165136/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:1128494/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:1106863/1‑62 (MQ=255)
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cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:1061260/1‑62 (MQ=255)
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cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:420696/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:407216/1‑62 (MQ=255)
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cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:435619/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:293030/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:277550/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:27433/1‑62 (MQ=255)
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cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:214859/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:197581/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:166558/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:16189/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:161006/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACACCATGTCGaa               >  1:705846/1‑49 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTCGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:223813/1‑62 (MQ=255)
cgcgAACGCTCACATTGGTCCTTTTTGTATCGTAGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTa  >  1:514993/1‑62 (MQ=255)
         |                                                    
CGCGAACGCACACATTGGTCCTTTTTGTATCGTTGGACCCCATGTCGAAATTGGTGAGGGTA  >  W3110S.gb/202622‑202683

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑