Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,983,892	T→C	R211R (CGA→CGG)	otsB ←	trehalose‑6‑phosphate phosphatase, biosynthetic

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,983,892	0	T	C	100.0%	81.6 / NA	30	R211R (CGA→CGG)	otsB	trehalose‑6‑phosphate phosphatase, biosynthetic
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/30);  total (0/30)

TGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGTCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGATT  >  W3110S.gb/1983856‑1983917                                     |                          tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:30782/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:87688/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:806586/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:667298/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:619867/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:554466/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:522004/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:490919/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:450583/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:417559/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:356955/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:350569/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:318082/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:1052530/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:27206/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:234045/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:1454684/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:144370/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:1398/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:128539/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:1279447/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:1252349/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:1180796/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:1172000/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:1168018/62‑1 (MQ=255) tGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:1058031/62‑1 (MQ=255)  gCACCTGTGCCTATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:1334983/61‑1 (MQ=255)  gCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:317703/61‑1 (MQ=255)  gCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:76187/61‑1 (MQ=255)                       gACATTCCGCCCAGCCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGAtt  <  1:242221/40‑1 (MQ=255)                                     |                          TGCACCTGTGCCAATTTTTACTGACATTCCGCCCAGTCGGTTAACGACTGCGAAGCCAGATT  >  W3110S.gb/1983856‑1983917

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑